| Bsoft 2.0.5 Bernard's software package

Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

### - d -

- DataType : utilities.h
- datatype_from_dm3_type() : rwDM.cpp
- DATLINELENGTH : bmgconvert.cpp
- DAXIS : mol_alpha.cpp
- defaultcode : rwresprop.cpp
- defaultprops : rwresprop.cpp
- defaultsim : rwresprop.cpp
- delete_a_character() : bfix.cpp
- deleteMontageSelection() : bshow_image.tcl
- deleteNonSelectedObjects() : bshow_model.tcl
- detect_and_fix_carriage_return() : file_util.h , file_util.cpp
- Diffraction() : bshow_diffraction.tcl , bshow_graph.tcl
- DISIZE : rwDI.h
- display_energy() : mol_monte.cpp
- display_energy_headers() : mol_monte.cpp
- distance() : Vector3.h
- DISTMAT_COMPTYPE1 : rwmodel_param.h
- DISTMAT_COMPTYPE2 : rwmodel_param.h
- DISTMAT_DIST : rwmodel_param.h
- DISTMAT_KD : rwmodel_param.h
- DISTMAT_KL : rwmodel_param.h
- DISTMAT_LLEN : rwmodel_param.h
- DISTMAT_POTTYPE : rwmodel_param.h
- dm3_type_length() : rwDM.cpp
- dm3_value() : rwDM.cpp
- dm_read_integer() : rwDM.cpp
- DMDataType : rwDM.h
- do_animate_slices() : bshow_scales.tcl
- do_average() : tcltk_bimage.cpp
- do_bin() : tcltk_bimage.cpp
- do_box() : tcltk_bbox.cpp , tcltk_bbox.h
- do_center() : tcltk_bimage.cpp
- do_component() : tcltk_bmodel.cpp
- do_component_type() : tcltk_bmodel.cpp
- do_components_to_particles() : tcltk_bmodel.cpp
- do_create_shell() : tcltk_bmodel.cpp
- do_crop() : tcltk_bimage.cpp
- do_ctf_fit() : tcltk_bmg.cpp
- do_delete() : tcltk_bimage.cpp , tcltk_bmodel.cpp
- do_delete_non_selected() : tcltk_bmodel.cpp
- do_diffraction_origin() : tcltk_bimage.cpp
- do_extract() : tcltk_bimage.cpp
- do_extract_segments() : tcltk_bmodel.cpp
- do_fft() : tcltk_bimage.cpp
- do_filament() : tcltk_bfil.cpp , tcltk_bfil.h
- do_find() : tcltk_bmodel.cpp
- do_fix_type() : tcltk_bimage.cpp
- do_gaussian() : tcltk_bimage.cpp
- do_get() : tcltk_bimage.cpp , tcltk_bmg.cpp , tcltk_bmodel.cpp
- do_histogram() : tcltk_bimage.cpp
- do_invert() : tcltk_bimage.cpp
- do_layerline() : tcltk_bhelix.cpp , tcltk_bhelix.h
- do_link() : tcltk_bmodel.cpp
- do_magnify() : tcltk_bimage.cpp
- do_marker() : tcltk_bmarker.h , tcltk_bmarker.cpp
- do_montage() : tcltk_bimage.cpp
- do_node() : tcltk_bfil.cpp , tcltk_bfil.h
- do_normalize() : tcltk_bimage.cpp
- do_pad() : tcltk_bimage.cpp
- do_powerspec() : tcltk_bimage.cpp
- do_radial_average() : tcltk_bimage.cpp
- do_rescale() : tcltk_bimage.cpp
- do_reslice() : tcltk_bimage.cpp
- do_rotate() : tcltk_bimage.cpp
- do_rps() : tcltk_bmg.cpp
- do_set() : tcltk_bimage.cpp , tcltk_bmg.cpp , tcltk_bmodel.cpp
- do_show() : tcltk_bimage.cpp
- do_spot() : tcltk_bxtal.cpp , tcltk_bxtal.h
- do_stats() : tcltk_bimage.cpp
- do_switch() : tcltk_bimage.cpp
- do_template() : tcltk_bimage.cpp
- do_tomo_findaxis() : tcltk_bmarker.cpp , tcltk_bmarker.h
- do_tomo_refine() : tcltk_bmarker.h , tcltk_bmarker.cpp
- do_tomo_refine_one() : tcltk_bmarker.cpp , tcltk_bmarker.h
- do_tomo_track() : tcltk_bmarker.h , tcltk_bmarker.cpp
- do_tomo_transfer_seed() : tcltk_bmarker.cpp , tcltk_bmarker.h
- do_truncate() : tcltk_bimage.cpp
- do_unitcell_vectors() : tcltk_bxtal.h
- do_variance() : tcltk_bimage.cpp
- do_zero_origin() : tcltk_bimage.cpp
- doAlignAverageFrames() : bshow_tomo.tcl
- doAlignParticles() : bshow_boxes.tcl
- doComponentSymmetry() : bshow_model.tcl
- doExtractParticles() : bshow_boxes.tcl
- doFindTiltAxis() : bshow_tomo.tcl
- doMarkerRefine() : bshow_tomo.tcl
- doMarkerTrack() : bshow_tomo.tcl
- doMarkerTransfer() : bshow_tomo.tcl
- doNormalizeImages() : bshow_tomo.tcl
- doReconstruct() : bshow_boxes.tcl
- doRefineParticles() : bshow_boxes.tcl
- doSelectParticles() : bshow_boxes.tcl
- doTemplatePicker() : bshow_boxes.tcl
- doTomoDenoise() : bshow_tomo.tcl
- doTomoPowerSpectra() : bshow_tomo.tcl
- doTomoReconstruct() : bshow_tomo.tcl
- doTomoResolution() : bshow_tomo.tcl
- Double : utilities.h
- double_gaussian_R() : mg_ctf_fit.cpp
- doVariancePicker() : bshow_boxes.tcl
- dp_matrix_backtrace() : dynamic_programming.h , dynamic_programming.cpp
- dp_matrix_scoring() : dynamic_programming.h , dynamic_programming.cpp
- drawCross() : bshow_magnify.tcl
- drawCTF() : bshow_ctf.tcl
- drawEllipse() : bshow_ctf.tcl
- drawGraph() : bshow_graph.tcl
- drawHelixAxis() : bshow_helix.tcl
- drawLine() : bshow_model.tcl
- drawMagBox() : bshow_magnify.tcl
- drawMagLine() : bshow_magnify.tcl
- drawMagMarker() : bshow_magnify.tcl
- drawMagSphere() : bshow_magnify.tcl
- drawMontageOverlay() : bshow_image.tcl
- drawOrigin() : bshow_misc.tcl
- drawRectangle() : bshow_graph.tcl
- drawSphere() : bshow_model.tcl
- drawSubGraph() : bshow_graph.tcl
- drawTiltAxis() : bshow_tomo.tcl
- DSN6SIZE : rwDSN6.h
- dsyevq3() : matrix.cpp , Matrix.h
- dsytrd3() : matrix.cpp , Matrix.h